Türkiye ve Japonya arasındaki ticari ilişkiler ise büyük ölçüde Japonya’nın lehine seyretmektedir. İki ülke arasındaki ikili ticaret hacmi 2021 verilerine göre dört buçuk milyar dolar civarındadır. Türkiye her sene Japonya’dan dört milyar dolarlık ürün ithal etmekte ve buna karşılık olarak beş yüz milyon dolarlık ithalat gerçekleştirmektedir. Ülkemizden Japonya’ya ihraç edilen ürünler arasında otomotiv parçaları, balıkçılık ürünleri, gıda, tekstil ve konfeksiyon ürünleri yer almaktadır. Buna karşılık olarak Türkiye Japonya’dan demir-çelik, otomotiv ürünleri, çeşitli kimyasallar, makineler ve cihazlar ithal etmektedir.
Dünyanın en büyük üçüncü ekonomisi konumundaki Japonya bir ada ülkesi olarak ticari faaliyetlerinde denizyolu taşımacılığından sonra en çok havayolu taşımacılığını tercih etmektedir. Uluslararası ticarette yer almak ve işlerini büyütmek isteyen firmalar için hızlı ve bir o kadar da güvenli bir sevkiyat imkanı sunan havayolu taşımacılığı Japonya’nın ithalat ve ihracat faaliyetlerinde önemli bir yer tutmaktadır. Türkiye ve Japonya arasında ticari faaliyetler ağırlıklı olarak denizyoluyla gerçekleştirilse de havayolu taşımacılığı Japonya’nın ülkemizden ithal ettiği gıda ürünlerinin sevkiyatında yaygın olarak tercih edilir. Türkiye’nin Japonya’dan ithal ettiği birçok ürünün sevkiyatı da havayolu taşımacılığının sunduğu hızlı, güvenilir ve esnek teslim avantajı ile gerçekleştirilmektedir. İki ülke arasındaki havayolu sevkiyatlarında Japonya’dan Kansai, Tokyo Narita, Chübu Centair, Tokyo Haneda ve Osaka uluslararası havalimanları ile Türkiye’den Esenboğa, İstanbul, İzmir Adnan Menderes ve Sabiha Gökçen havaalanları yaygın olarak tercih edilmektedir. Uçak kargo aracılığıyla sevkiyatları gerçekleştirilecek olan ürünlerin ilgili havalimanlarına nakliyesi ise karayolu üzerinden gerçekleştirilmekte ve varış noktasında yine karayolu taşıma araçları ile ülke içerisine dağıtımları sağlanmaktadır.
